《时之歌Project》被抵制的原因主要有以下几点：

1. 版权及资金分割问题导致的纷争和资本内斗，影响了该企划的后续发展。
2. 吾恩等人气明星因病暂退引发的团队内斗，导致项目失去了原有的味道和意味。
3. 音乐物语企划商业化变现困难，因为缺乏故事吸引力、音乐质量、资金等问题接连夭折。

此外，也有人认为该音乐物语企划的初衷不再以“物语音乐”的内核，且大肆更改世界观，导致内容崩塌难以维持当年的盛景。因此，尊重和保护原创是发展音乐物语企划的重要前提。总的来说，该事件的主要问题在于资本介入引发的各种纷争和项目发展模式的问题。